Bioinformatik-Experte (m/w/d)
Über die Rolle
Mercor stellt Bioinformatik-Experten ein, die dabei helfen, zu bewerten, wie gut KI-Modelle reale wissenschaftliche Datenanalysearbeit bewältigen. Sie entwerfen originelle, mehrstufige Bioinformatik-Aufgaben mit exakten, objektiven Antworten und erstellen anschließend die Validierungsarbeit, die zur Bestätigung dieser Antworten erforderlich ist.
Ihre Aufgaben
- Realistische, mehrstufige Datenanalyseaufgaben in der Bioinformatik abschließen
- Originelle Bioinformatik-Fragen mit exakten, objektiven Antworten formulieren
- Daten auswählen und anonymisieren (z. B. aus GEO, SRA/ENA, ArrayExpress, PRIDE, PDB, MGnify oder eigenen unveröffentlichten Labordaten), die von den Modellen analysiert werden sollen
- Wissenschaftliche Software, Code und Kommandozeilen-Tools nutzen, um reproduzierbare Analysen und strukturierte Ergebnisse zu erstellen
- Ein Jupyter-Validierungsnotebook in Python oder R erstellen, das die korrekte Antwort auf Ihre Frage reproduziert
- Ergebnisse in ihrem biologischen oder translationalen Kontext interpretieren und dabei Annahmen, Unsicherheiten und Schlussfolgerungen klar darlegen
Anforderungen
- Master- oder Doktortitel (oder gleichwertige Forschungserfahrung) in Bioinformatik, Computational Biology, Genomik, statistischer Genetik, quantitativer Biologie oder einem verwandten Fachgebiet
- Praktische Erfahrung in der Analyse von Sequenzierungs-/Omics-Daten (Bulk- oder Einzelzell-RNA-Seq, WGS/WES, Variant Calling, Metagenomik, Proteomik oder Ähnliches), von den Rohdaten bis zur Interpretation
- Erfahrung mit Tools wie samtools, bcftools, bedtools, BWA, Bowtie2, BLAST sowie Python (pandas, Biopython, pysam) oder R/Bioconductor (DESeq2, edgeR, limma, GenomicRanges)
- Fähigkeit, Jupyter-Notebooks zu schreiben und auszuführen, die Ihre Arbeit exakt reproduzieren
- Klare, präzise wissenschaftliche Schreibweise
- Zugang zu unveröffentlichten oder privaten Datensätzen, die Sie teilen dürfen, sowie tiefgehende Expertise in einem Nischenbereich sind starke Pluspunkte
Vergütung und Rahmenbedingungen
- $90-$110/Std., remote, keine angegebene Standortbeschränkung
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